Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf628Q8CJ78 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms