Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SbsnQ8CIT9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SbsnQ8CIT9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SbsnQ8CIT9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SbsnQ8CIT9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms