Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nupl2Q8CIC2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nupl2Q8CIC2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms