Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms