Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc17Q8CE13 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc17Q8CE13 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc17Q8CE13 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms