Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc73Q8CDM4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc73Q8CDM4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms