Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB65

Nemp2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp2Q8CB65 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nemp2Q8CB65 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nemp2Q8CB65 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms