Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8C708 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8C708 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8C708 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8C708 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8C708 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8C708 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8C708 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms