Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp5Q8BX09 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp5Q8BX09 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms