Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp38Q8BW70 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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