Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnrc6bQ8BKI2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnrc6bQ8BKI2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms