Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmco3Q8BH01 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmco3Q8BH01 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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