Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8BGN9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q8BGN9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8BGN9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8BGN9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8BGN9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q8BGN9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms