Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubash3bQ8BGG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms