Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trmt12Q8BG71 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt12Q8BG71 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms