Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.3Q85ZW6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms