Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srgap3Q812A2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms