Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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ChfrQ810L3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ChfrQ810L3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms