Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cracr2bQ80ZJ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms