Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thnsl2Q80W22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms