Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Avl9Q80U56 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms