Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cul9Q80TT8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cul9Q80TT8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cul9Q80TT8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cul9Q80TT8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cul9Q80TT8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul9Q80TT8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cul9Q80TT8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cul9Q80TT8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cul9Q80TT8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms