Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Clec18aQ7TSQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Clec18aQ7TSQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Clec18aQ7TSQ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Clec18aQ7TSQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clec18aQ7TSQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec18aQ7TSQ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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