Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdp1Q7TSG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdp1Q7TSG2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms