Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg1cQ7TSF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms