Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sys1Q78S06 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms