Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sned1Q70E20 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sned1Q70E20 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms