Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Syne2Q6ZWQ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Syne2Q6ZWQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms