Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ncapd3Q6ZQK0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncapd3Q6ZQK0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms