Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ino80Q6ZPV2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ino80Q6ZPV2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80Q6ZPV2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms