Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf653Q6YND2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf653Q6YND2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms