Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tfap2eQ6VUP9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2eQ6VUP9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms