Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300ld3Q6SJQ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms