Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja6Q6S5G4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja6Q6S5G4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms