Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd1Q6PIP5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nudcd1Q6PIP5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms