Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup98Q6PFD9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup98Q6PFD9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup98Q6PFD9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms