Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snrnp40Q6PE01 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrnp40Q6PE01 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms