Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcc2Q6PDG5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcc2Q6PDG5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smarcc2Q6PDG5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcc2Q6PDG5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcc2Q6PDG5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms