Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttbk1Q6PCN3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttbk1Q6PCN3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttbk1Q6PCN3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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