Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhb9Q6PB60 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlhb9Q6PB60 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhb9Q6PB60 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1124.3 ms