Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atl2Q6PA06 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atl2Q6PA06 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms