Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fhod1Q6P9Q4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fhod1Q6P9Q4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms