Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Soga3Q6NZL0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Soga3Q6NZL0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms