Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tvp23aQ6NVH0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tvp23aQ6NVH0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms