Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CltbQ6IRU5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms