Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Best3Q6H1V1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Best3Q6H1V1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Best3Q6H1V1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms