Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nop58Q6DFW4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop58Q6DFW4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop58Q6DFW4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms