Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1549Q68FD9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms