Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CltcQ68FD5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CltcQ68FD5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CltcQ68FD5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CltcQ68FD5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms