Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms